第五，区域创新环境的优势已成为吸引创新和激发创新活动的重要因素。具有萌芽“创新中心”的深圳和杭州等地区并没有创新元素的先天优势。其集聚创新要素和活动的能力来自于长期改革创新所形成的区域体系相对优势。

国际经验表明，创新资源和创新活动在区域间的分布不仅是不平衡的，而且其不平等程度要高于其他经济活动。这种现象已经在我国出现，而且将继续分化下去。在创新分布不均的诸多因素中，创新环境的优劣占据重要地位。实践证明，在同一个国家制度框架下可以存在完全不同的区域创新体系。如，美国加州的硅谷和马萨诸塞州128公路，虽然都是著名高校和研究机构的聚集地，两者的创新体系却有本质不同。硅谷创新体系更开放、灵活、要素流动性高。结果导致了两者不同的创新模式和发展道路。但区域创新体系是可以变化的。20世纪90年代以来，马萨诸塞州创新体系开始从传统体系向更加开放的新经济创新系统演变，从而促进了生物技术等新兴产业的生成和发展。从国际上看，硅谷式的创新体系已经成为各国和地区学习和发展的目标。
  对仍处在转型阶段的我国来说，经济发展和创新规律是解释创新分布不平衡的部分原因。政府在创新资源配置和创新体系建设中的作为才是导致区域差异的根源所在。